分子克隆有詳細(xì)的描述,具體步驟如下:
1、估算含有質(zhì)粒溶液的體積V,加入V/9體積的3M NaAc,(我喜歡在質(zhì)粒溶液中再加入一定量的水,使得總體積大概在270ul 左右,之后加30ul NaAc)使NaAc終濃度為0.3M。
2、加入2倍體積冰冷無水乙醇,冰上孵育或-20度 20min,
3、**大速度離心10min,
4、用75%乙醇洗滌2次(每次700ul即可),
5、室溫晾干,
6、加入適當(dāng)體積的水或TE buffer溶解即可。
質(zhì)粒濃縮的辦法總的來說是利用乙醇沉淀DNA的原理進(jìn)行.shou先你應(yīng)當(dāng)確定你提取的質(zhì)粒量有多大,體積多少,這樣才好確定濃縮的優(yōu)化策略,詳細(xì)步驟介紹如下:
1 確定體積,一般需要加2.5倍原始DNA溶液體積的95%乙醇(如果你提的質(zhì)粒純度好的話,可以將乙醇在-20度冰箱預(yù)冷后加入效果更好),同時(shí)加入1/10倍原始DNA溶液體積的醋酸鈉(3M,pH4.8),;
2 離心,以離心機(jī)**大速度(13000rpm以上)離心10分鐘;
3 倒掉上清,用10ul槍頭吸去離心管里剩余的水,但不要吸到DNA;
4 室溫放置10~15分鐘,直**DNA剛剛晾干,但又不能干透成白色不透明狀;
5 用適量去離子水或TE溶解**你所需要的濃度。
為了濃縮達(dá)到你所需要的濃度,你應(yīng)先對(duì)質(zhì)粒定量,如果質(zhì)粒總量小于2ug,在沉淀時(shí)可以加入1ul的糖原,以便于操作。
biomiga-EndoFree plasmid ezFlow maxi kit(快速法)-內(nèi)有質(zhì)粒濃縮方法 注:得到的DNA需要濃縮,請(qǐng)加入0.1倍體積的3M的醋酸鈉(pH5.2)和0.7倍體積的異丙醇,室溫10min,室溫下高速離心10分鐘,底部可見白色的DNA沉淀,棄去上清,加入1 mL70%乙醇,高速離心5分鐘,棄去上清,空氣干燥20分鐘,加入Endofree Elution Buffer重新溶解質(zhì)粒DNA。 沉淀DNA時(shí),醋酸鈉和異丙醇一定要用常溫的否則鹽可能也被沉淀下來。
如果提取的不是特別微量的樣品, 乙醇或異丙醇沉淀的時(shí)間**好不要太長, 因?yàn)檫^長時(shí)間的沉淀會(huì)造成沉淀中的鹽分升高, 影響PCR和酶切.
因此我個(gè)人都是:genomic DNA: 2V乙醇+0.1V 3M NaAc,室溫10min; plasmid(堿裂解法):2V乙醇/1V異丙醇,室溫10min; RNA: 1V異丙醇,室溫5min(很多G外RNA相關(guān)實(shí)驗(yàn)的Kit專門說明了不要超過5min,否則有可能影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)). 低溫有助于低豐度/小片段沉淀, 因此可以據(jù)具體情況-20度沉淀,但沉淀的時(shí)間**好不要太長, 事實(shí)上長時(shí)間不會(huì)對(duì)沉淀量有質(zhì)的改變,因此結(jié)合保證質(zhì)量和提高效率兩大原則,不要選擇長時(shí)間沉淀. 當(dāng)室溫靜置片刻后離心,看不見沉淀,大可以再移入 -20C 處理的。