蛋白質(zhì)濃縮問題——超濾濃縮管的使用及保存
二、離心超濾管濃縮樣品
2.1 濃縮樣品
1、要濃縮的樣品含鹽量必須0.3M以上,含鹽量低的樣品須補(bǔ)加到0.3MNaCl。
2、在內(nèi)管(附有3KD膜)中加入500µl樣品,將內(nèi)管套入外管。
3、對稱放置離心管,14520rpm(即14000g)離心。(離心5min約濃縮2倍,10min約4倍,15min約6倍,20min約8倍,30min約10倍)。
4、離心結(jié)束后,將內(nèi)管倒置套在另一個(gè)干凈的離心管呢,3880rpm離心min收集濃縮后的樣品。或者用移液器直接吸出內(nèi)管中的樣品。
2.2 濃縮管使用后的處理和保存
1、使用完的濃縮管,立即加入500µl含1MNaCl的緩沖液(此緩沖液與濃縮樣品的緩沖液一致),8000rpm離心20min。
2、甩凈內(nèi)管中的鹽溶液,將內(nèi)管放入超純水中浸泡1h。
3、內(nèi)管加入超純水500µl,8000rpm離心5min。
4、甩凈內(nèi)管中的水,加入500µl0.2MNaOH,8000rpm離心20min。
5、甩凈內(nèi)管中的NaOH溶液,用超純水再8000rpm離心5min。
6、甩凈內(nèi)管中的水,放入含0.2-0.5‰NaN3的生理鹽水中。
7、外管用自來水洗凈后,用超純水沖洗干凈,晾干。
超濾管使用注意事項(xiàng)
蛋白濃縮和換Buffer通常使用的超濾管,常用Millipore的Amicon-Ultra-15超濾管(MWCO10kD)。也有其它型號 的、不同體積大小和MWCO超濾管可選,視目的蛋白的分子量與濃縮前體積、濃縮目標(biāo)體積而定。可重復(fù)使用,使用一次就扔掉太浪費(fèi)。以下是個(gè)人總結(jié)的使用方 法和注意事項(xiàng)。
1、選擇合適的超濾管,主要考慮MWCO和濃縮體積,**常見的是Ultra-15(10kD)。到底選擇多大截留分子量比較合適呢?10kDa、 5kDa、還是30kDa?通常應(yīng)截留分子量不應(yīng)大于目的蛋白分子量的1/3,比如目的蛋白分子量為35kDa,就可以選擇10kDa截留分子量的超濾管。若目的蛋白分子量為10kD左右,則可以用截留分子量3kD的超濾管。認(rèn)真閱讀使用說明書,注意超濾膜對各種化學(xué)物質(zhì)的耐受程度有所不同,表格中有。
2、新買來的超濾是干燥的,使用前加入MilliQ水,水量完全過膜,冰浴或冰箱里預(yù)冷幾分鐘。然后將水倒出,即可加入蛋白液,加入的多少,以不超過管頂?shù)陌拙€為準(zhǔn)。操作要輕,加入蛋白液前,超濾管需要插在冰上預(yù)冷。
3、平衡。質(zhì)量和重心二者都要達(dá)到平衡。注意轉(zhuǎn)速和加速度不可太快,否則直接損壞超濾膜。開始離心超濾(離心機(jī)預(yù)冷**4度)。不同離心機(jī)的轉(zhuǎn)速 rpm換算成g之后,有所不同。具體可參閱附件里的說明書。離心機(jī)的加速度調(diào)****低檔,減小對膜的壓力。注意,一定要等離心機(jī)達(dá)到目的轉(zhuǎn)速之后,方可離開 離心機(jī),否則離心機(jī)出問題時(shí),無法**時(shí)間處理,后果不可預(yù)測!膜與轉(zhuǎn)軸的方向根據(jù)說明書調(diào)整(角轉(zhuǎn)離心機(jī)的情況是膜與軸垂直)。在實(shí)際使用中,一般轉(zhuǎn)速 開的比說明書里的要低,這樣可以延長離心管的使用壽命。
4、當(dāng)濃縮到剩下1ml時(shí),取50ulG產(chǎn)Bradford溶液,加入10ul流穿,看有沒變藍(lán)色,以此判斷超濾管是否漏掉蛋白。如果管漏了,將上層和流穿重新倒入新管中開始超濾。要精確判斷是否漏管,用5mgml的BSA離心10min,再取流穿,跑蛋白膠或Bradford粗測,繼續(xù)加入剩下的蛋白液濃縮(在冰上操作,防止蛋白受熱),直到所有濃縮液都加完為止。離心過程中注意是否發(fā)生蛋白沉淀,導(dǎo)致堵管。若發(fā)生沉淀,要確定沉淀的具體原因,是蛋白濃度過高還是Buffer不合適;前者可用多根超濾管同時(shí)超濾,降低濃度的辦法解決,后者的方法是換不同的Buffer,直到蛋白不發(fā)生沉淀為 止。
5、前面幾步用以濃縮蛋白,如果要換Buffer,在總蛋白液濃縮**1ml左右的時(shí)候,輕輕加入新的Buffer(經(jīng)0.22um超濾膜超濾),再 濃縮**1ml左右,連續(xù)三次,**后一次的濃縮終體積根據(jù)需要的蛋白濃度而定,一般不多于500ul,也有濃縮**200ul以內(nèi)的情況。按照每次**少10倍 左右的體積濃縮算,三次達(dá)到1000倍以上,基本上可以達(dá)到換buffer的目的。